MIC-3399搭载第 6 代 Intel® 14nm Core™i3/i5/i7 处理器（ 4 核/8 线程，CPU 频率 2.8GHz，三级缓存 8MB），通过最新的虚拟化技术和 CPU 优化设计提高计算性能。其板载低压 DRAM (1.2V) 支持 ECC（可选)，SODIMM 插槽支持内存扩展，最高可实现 32GB 内存容量，能够满足高性 能或虚拟化环境应用中的严苛要求。MIC-3399 采用双通道设计，内存传输速度高达 2133MT/s，再加上缓存容量扩展和缓存算法优化，保证了 最高的内存性能。强大的 Intel® C230 系列芯片组利用 8GTs DMI 和第 3 代 PCIe 接口实现了 I/O 性能提升。板载 XMC 提供 PCIe x8 3.0 接口， 支持快速装卸 I/O卡，如 MIC-3666 双 10GE XMC 卡。对 SATA-III 和 7Gbps I/O 的支持使 MIC-3399 受益于最新升级的存储技术，例如增加了对 高速 SSD 或传统 HDD等的应用。此外，基于 Intel®GbE 控制器的 5 个千兆位以太网端口（包括 2 个 PICMG 2.16）可支持前端和后端连接，保 证了卓越的网络连接。
 与前几代集成图形引擎相比，Iris 增强图形引擎的性能提升了两倍之多。MIC-3399 支持独立三显，能够充分满足工作站应用的严苛需求。 凭借具备可靠性、可用性、可维护性、有效性和可管理性的 CPU 和芯片组，以及基于 PICMG 2.9 和 IPMI 的管理性能，使 MIC-3399 成为一款 具有高可用性和高可靠性的计算引擎。 后走线模块 RIO-3316 支持 PS/2 接口、键盘鼠标接口、USB接口、RS-232 端口、SATA 端口、DVI 接口、千兆位以太网接口。